Can we Trust Untargeted Metabolomics: Results of the Metabo-ring Initiative, a Large-scale Multi-instruments Inter-laboratoire Study - AgroParisTech
Poster De Conférence Année : 2013

Can we Trust Untargeted Metabolomics: Results of the Metabo-ring Initiative, a Large-scale Multi-instruments Inter-laboratoire Study

Jean-Charles Martin (1) , Mathieu Maillot (1) , Gerard Mazerolles (2) , Alexandre Verdu (3) , Bernard Lyan (4) , Carole Migné (4) , Catherine Defoort (1) , Cécile Canlet (5) , Christophe Junot (6) , Claude Guillou (7) , Claudine Manach (4) , Daniel Jabob (8) , Delphine Jouan-Rimbaud Bouveresse (9) , Estelle Rathahao-Paris (9) , Estelle Pujos-Guillot (4) , Fabien Jourdan (5) , Franck Giacomoni (4) , Frédérique Courant (10, 10) , Gaelle Fave (1) , Gwenaëlle Le Gall (11) , Hubert Chassaigne (7) , Jean-Claude Tabet (12) , Jean-Francois Martin (4) , Jean-Philippe Antignac (10) , Laetitia Shintu (13) , Marianne Defernez , Mark Philo (11) , Marie-Cécile Alexandre Gouaubau (13) , Marie Josephe Amiot-Carlin (1) , Mathilde Bossis (7) , Mohamed Triba (14) , Nathali Stojilkovic (15) , Nathalie Banzet , Roland Molinié (16) , Romain Bott (1) , Sophie Goulitquer (17) , Stefano Caldarelli (13) , Douglas Rutledge (9)
1 NORT - Nutrition, obésité et risque thrombotique
2 SPO - Sciences Pour l'Oenologie
3 bruker
4 UNH - Unité de Nutrition Humaine
5 UTA - Toxicologie Alimentaire
6 SPI - Service de Pharmacologie et Immunoanalyse
7 Institute for Health and Consumer Protection
8 BFP - Biologie du fruit et pathologie
9 GENIAL - Ingénierie Procédés Aliments
10 LABERCA - Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
11 Norwich Research Park
12 IPCM - Institut Parisien de Chimie Moléculaire
13 ISM2 - Institut des Sciences Moléculaires de Marseille
14 CSPBAT - Chimie, Structures et Propriétés de Biomatériaux et d'Agents Thérapeutiques
15 LCH - Laboratoire des Courses Hippiques
16 BIOPI - Biologie des Plantes et Innovation - UR UPJV 3900
17 SBR - Station biologique de Roscoff [Roscoff]
Jean-Charles Martin
Nutrition, obésité et risque thrombotique
Mathieu Maillot
  • Fonction : Auteur
Nutrition, obésité et risque thrombotique
Gerard Mazerolles
  • Fonction : Auteur
Sciences Pour l'Oenologie
Alexandre Verdu
  • Fonction : Auteur
bruker
Bernard Lyan
Unité de Nutrition Humaine
Carole Migné
Unité de Nutrition Humaine
CV
Catherine Defoort
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1203307
Nutrition, obésité et risque thrombotique
Cécile Canlet
Toxicologie Alimentaire
Christophe Junot
  • Fonction : Auteur
Service de Pharmacologie et Immunoanalyse
Claude Guillou
  • Fonction : Auteur
Institute for Health and Consumer Protection
Claudine Manach
Unité de Nutrition Humaine
Daniel Jabob
  • Fonction : Auteur
Biologie du fruit et pathologie
Delphine Jouan-Rimbaud Bouveresse
Ingénierie Procédés Aliments
CV
Estelle Rathahao-Paris
Ingénierie Procédés Aliments
Estelle Pujos-Guillot
Unité de Nutrition Humaine
CV
Fabien Jourdan
Toxicologie Alimentaire
CV
Franck Giacomoni
Unité de Nutrition Humaine
Frédérique Courant
Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
CV
Gaelle Fave
  • Fonction : Auteur
Nutrition, obésité et risque thrombotique
Gwenaëlle Le Gall
  • Fonction : Auteur
Norwich Research Park
Hubert Chassaigne
  • Fonction : Auteur
Institute for Health and Consumer Protection
Jean-Claude Tabet
Institut Parisien de Chimie Moléculaire
Jean-Francois Martin
  • Fonction : Auteur
Unité de Nutrition Humaine
Jean-Philippe Antignac
Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
CV
Laetitia Shintu
Institut des Sciences Moléculaires de Marseille
Marianne Defernez
  • Fonction : Auteur
Mark Philo
  • Fonction : Auteur
Norwich Research Park
Marie-Cécile Alexandre Gouaubau
  • Fonction : Auteur
Institut des Sciences Moléculaires de Marseille
Marie Josephe Amiot-Carlin
Nutrition, obésité et risque thrombotique
CV
Mathilde Bossis
  • Fonction : Auteur
Institute for Health and Consumer Protection
Mohamed Triba
  • Fonction : Auteur
Chimie, Structures et Propriétés de Biomatériaux et d'Agents Thérapeutiques
Nathali Stojilkovic
  • Fonction : Auteur
Laboratoire des Courses Hippiques
Nathalie Banzet
  • Fonction : Auteur
Roland Molinié
Biologie des Plantes et Innovation - UR UPJV 3900
Romain Bott
  • Fonction : Auteur
Nutrition, obésité et risque thrombotique
Sophie Goulitquer
  • Fonction : Auteur
Station biologique de Roscoff [Roscoff]
Stefano Caldarelli
  • Fonction : Auteur
Institut des Sciences Moléculaires de Marseille
Douglas Rutledge
Ingénierie Procédés Aliments

Résumé

The metabo-ring initiative brought together five nuclear magnetic resonance instruments (NMR) and 11 different mass spectrometers with the objective of assessing the reliability of untargeted metabolomics approaches in obtaining comparable metabolomics profiles. This was estimated by measuring the proportion of common spectral information extracted from the different LCMS and NMR platforms. Biological samples obtained from 2 different conditions were analysed by the partners using their own inhouse protocols. Test #1 examined urine samples from adult volunteers either spiked or not spiked with 32 metabolite standards. Test #2 involved a low biological contrast situation comparing the plasma of rats fed a diet either supplemented or not with vitamin D. The spectral information from each instrument was assembled into separate statistical blocks. Correlations between blocks (e.g., instruments) were examined (RV coefficients) along with the structure of the common spectral information (common components and specific weights analysis). In addition, in Test #1, an outlier individual was blindly introduced, and its identification by the various platforms was evaluated. Despite large differences in the number of spectral features produced after post-processing and the heterogeneity of the analytical conditions and the data treatment, the spectral information both within (NMR and LCMS) and across methods (NMR vs. LCMS) was highly convergent (from 64 to 91 % on average). No effect of the LCMS instrumentation (TOF, QTOF, LTQ-Orbitrap) was noted. The outlier individual was best detected and characterised by LCMS instruments. In conclusion, untargeted metabolomics analyses report consistent information within and across instruments of various technologies, even without prior standardisation.

Domaines

Alimentation et Nutrition

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https://hal.science/hal-01123136

Soumis le : mercredi 4 mars 2015-20:23:53

Dernière modification le : vendredi 15 novembre 2024-09:26:16

Fichier non déposé

Dates et versions

hal-01123136 , version 1 (04-03-2015)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01123136 , version 1
  • PRODINRA : 273623

Citer

Jean-Charles Martin, Mathieu Maillot, Gerard Mazerolles, Alexandre Verdu, Bernard Lyan, et al.. Can we Trust Untargeted Metabolomics: Results of the Metabo-ring Initiative, a Large-scale Multi-instruments Inter-laboratoire Study. 9. Annual Conference of the Metabolomics Society, Jul 2013, Glasgow, United Kingdom. 2013, 9th Annual Conference of the Metabolomics Society. ⟨hal-01123136⟩

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